Рабочая станция воспринимает паузу в выполнении вашего принтерного задания за окончание печати и начинается выполнение нового задания.
Увеличьте значение тайм-аута при печати с помощью команды NET LPT TIMEOUT
Более подробная информация о параметрах программы NET содержится в Интерактивном Справочнике.